一、为何选择外周血?
外周血因易获取且含大量白细胞(含细胞核DNA),成为DNA提取的理想样本。其应用覆盖肿瘤基因检测(如ctDNA分析)、亲子鉴定、遗传病诊断等领域。
二、DNA提取的核心原理
提取过程需突破三重屏障:
红细胞裂解:利用渗透压差异(如NH4Cl溶液)选择性裂解无核红细胞。
白细胞破碎:表面活性剂(如SDS)破坏细胞膜和核膜,释放DNA。
去杂质与沉淀:通过酚/氯仿抽提去除蛋白质,高盐乙醇沉淀DNA。
三、标准化操作流程
样本采集
使用EDTA抗凝管采集5ml静脉血,室温保存≤2小时,4℃不超过5小时。
避免溶血或凝血,否则影响DNA纯度。
红细胞裂解
加入红细胞裂解液(如ELS:NH4Cl+Tris缓冲液),离心去除碎片。
重复裂解直至沉淀呈乳白色(白细胞富集)。
DNA释放与纯化
裂解白细胞:SDS+蛋白酶K消化核蛋白。
去蛋白:酚/氯仿抽提后离心分层,保留上层含DNA水相。
沉淀DNA:加入冷乙醇/异丙醇析出DNA絮状物。
洗涤与保存
70%乙醇洗涤去除盐分,TE缓冲液溶解DNA,-20℃长期保存。
四、鉴定DNA质量的三大指标
浓度与纯度
紫外分光光度计检测:
A260/A280比值1.7-2.0表示高纯度(蛋白质污染少)。
浓度计算:DNA(μg/μL)=A260×50×稀释倍数。
完整性验证
琼脂糖凝胶电泳:清晰主条带(约23kb)表明DNA完整。
PCR扩增:特定基因片段成功扩增提示DNA可用性。
五、常用提取方法对比
方法优点缺点适用场景
酚/氯仿法高纯度,适用于Southern blot步骤繁琐,有毒试剂科研(需高质量DNA)
盐析法成本低,无需有机溶剂纯度略低常规PCR检测
磁珠法/试剂盒快速(1-2小时),高通量成本较高临床检验
六、关键注意事项
防污染:使用无菌环境、一次性耗材,避免外源DNA干扰。
防降解:操作轻柔减少机械剪切,添加EDTA抑制DNA酶。
试剂质量:定期检查裂解液pH值,避免酸性酚导致DNA损失。
七、实际应用场景
肿瘤诊断:检测ctDNA中的基因突变指导精准用药。
遗传病筛查:通过WES全外显子测序分析致病基因。
法医学:STR分型用于个体识别和亲子鉴定。
结语
外周血DNA提取与鉴定技术虽已成熟,仍需严格质控。随着自动化提取和测序技术的发展,该技术将在个性化医疗中发挥更大作用。未来,纳米孔测序等新技术或进一步简化流程,推动即时检测(POCT)的普及。